科学家绘出人类与病毒蛋白质间相互作用图谱

科学家绘出人类与病毒蛋白质间相互作用图谱
来历: 科技日报美国哥伦比亚大学研讨人员开宣布一种用于揣度病毒蛋白质和人类蛋白质间相互效果的核算结构,使用该办法获取了许多关于病毒是怎么感染人类的信息,并制作出了一切已知可感染人类的病毒与其感染细胞间蛋白质相互效果的图谱。相关论文宣布在近来的《细胞》杂志上。病毒是细胞内的寄生微生物,它会经过蛋白质间的相互效果来使用细胞机制,而细胞也相同依托这种效果来发动应对病毒侵略的免疫反响机制。因而,了解蛋白质间的相互效果关于了解病毒与宿主细胞的联系至关重要。现在,科学家首要经过高通量办法来研讨蛋白质间的相互效果,尽管获取了许多新发现,但这种办法在可扩展性方面的缺乏也约束了研讨。此次,哥伦比亚大学研讨人员开发的核算结构P-HIPSTer,使用蛋白质结构信息揣度病毒蛋白和人类蛋白之间的相互效果,能有用补偿高通量办法扩展性缺乏的缺点。经过P-HIPSTer,研讨人员对已知的1000余种可感染人类的病毒及其编码的大约13000种蛋白质进行了研讨,终究制作出人类病毒蛋白质间相互效果图谱。该图谱涵盖了大约28.2万个或许的相互效果蛋白对,其所提醒的生物学信息对人类免疫学和流行症研讨具有重要价值。除了承认人类病毒蛋白质相互效果外,P-HIPSTer还帮研讨人员获取了许多关于病毒怎么感染人类细胞并导致疾病的信息,包含雌激素受体在调理寨卡病毒感染中的效果、人乳头瘤病毒怎么导致癌症、病毒怎么影响人类基因组等等。研讨人员表明,现在科学家对病毒蛋白质与人类蛋白质间相互效果的了解并不深化,期望新制作的图谱能为科学界供给更多的研讨资源,协助科学家获取更多的生物学信息。下一步,他们计划将P-HIPSTer用于一些更杂乱病原体,如寄生虫和细菌的研讨;而未来,他们或许用这一东西来研讨影响农作物或家畜的病毒或病原体。(刘海英)

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